萤介与露诺雅为了修理铳剑，被叫到AAA的基地，



而且是以「只有二年级突然参加临海校外教学」的形式。



正当露诺雅在海滩玩耍时，亚洲中央区域军的林美琳少校忽然现身，对她提出挑战。



林美琳是年仅十岁就获得铳剑姬名号的天才。



因为过去的心灵创伤遭到利用，变得对黄司令言听计从……



在与巨大异界人凯克洛普斯的战斗中，萤介告诉美琳：



「美琳，成为能抬头挺胸面对已故好友的自己吧。」



对过去事件释怀的美琳，最后与露诺雅合力击败了巨大异界人。



萤介与同居的露诺雅、珂洛依、娜娜以及美琳在美砂的邀约下来到游泳池。



然而就在此时，露诺雅等人的前队友菲雅，



竟被异界人迪古斯操纵，袭击了AAA南美区域军的旗舰。



迪古斯的目的是获得《刻印银弹（Code Silver Bullet）》。



面对敌人压倒性的强悍，无力反击的AAA终究只能让银弹被夺走。



最后剩下的银弹，只有萤介手中的两颗……



而就在萤介眼前，银弹竟变成了一名自称希儿芭雷特的少女。



也许是因为就近感受到萤介的灵魂而产生感情，她警告萤介最大的危机即将到来。



露诺雅一行人接着迎击来袭的迪古斯。



虽然最后辛苦击败敌人，但大家也身负重伤，且与异界相通的门终究还是敞开了。



就在众人皆为这最糟的结局哀叹时，唯独鹰音的表现不同。



她看着倒在血泊中的龙崎萤介，以及失去后半枪身的统剑（Gunsword）<零式（Zero）改>,



竟如此说道：



「在这场战斗中，我们所获得的——



是真正的刻印银弹（Code Silver Bullet），以及圣人的存在。」